Además, la planta del cedrón está constituída por una alta cantidad de unas sustancias llamadas flavonoides, las cuales resultan ser antimicrobianos. Debido a los flavonoides es que el cedrón posee propiedades antisépticas. También se le atribuyen a los flavonoides excelentes propiedades para prevenir la aparición de enfermedades como el cáncer.
Dentro de la composición del cedrón destacan en abundancia los monoterpenos, los aldehídos y las sustancias furanocumarinas.
